Phân tích hộp sọ hổ Hoa Nam cho thấy chúng có hình dạng khác với hộp sọ hổ của các khu vực khác. Do hiện tượng này, hổ Hoa Nam được coi là quần thể của loài hổ "thân". Kết quả của một nghiên cứu về thực địa học cho thấy miền nam Trung Quốc hoặc phía bắc Đông Dương có khả năng là trung tâm của bức xạ hổ thế Pleistocene.

Năm 2017, lực lượng đặc nhiệm phân loại thú họ mèo của nhóm chuyên gia mèo đã đặt tên danh pháp cho toàn bộ quần thể hổ châu Á là P. t. tigris. Tuy nhiên, một nghiên cứu di truyền được công bố vào năm 2018 chỉ công nhận danh pháp chung cho sáu nòi hổ, trong đó hổ Hoa Nam khác biệt với các quần thể hổ châu Á đại lục khác, do đó ủng hộ khái niệm truyền thống về sáu phân loài.